Durante o triénio 2011-2013 o Museu colaborou com o ANILUPA/ CLIA – Centro Lúdico da Imagem Animada da Associação de Ludotecas do Porto e com diversas instituições museológicas e sociais do Centro Histórico do Porto, na segunda edição do Projeto “Porto Desconhecido”.
Registar, valorizar e animar, através da técnica do cinema de animação, histórias de vida da população sénior desta zona foram os objetivos gerais do projeto. À semelhança da 1ª edição, o Museu trabalhou em estreita proximidade com o Centro Social da Paróquia de Miragaia.